Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1636230	1636270	41	13 [0]	[0] 10	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

TCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTC  >  minE/1636168‑1636229                                                              | tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCTTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:2034471/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:116298/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:1192031/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:1195859/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:1240007/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:1821986/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:2032769/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:2502121/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:258809/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:449076/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:603781/62‑1 (MQ=255) tCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:839762/62‑1 (MQ=255)  cTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTc  <  1:3003069/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTC  >  minE/1636168‑1636229

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑