Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1636426	1636438	13	100 [0]	[0] 51	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

GAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTC  >  minE/1636389‑1636425                                     | taaTCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1817195/36‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTTAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1781165/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2985080/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3155376/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:313319/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3126975/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:312209/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:309225/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3088346/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3072459/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3061762/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3039994/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3033757/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3185667/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2972596/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2967258/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2944491/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2910297/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2902243/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2848992/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2822179/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2814304/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2788614/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:276121/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2732200/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2662407/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:565452/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:938042/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:91831/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:880556/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:879470/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:836668/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:810527/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:795245/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:773070/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:751770/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:74836/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:659120/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:644554/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2497442/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:517181/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:471899/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:469239/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:452101/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:381758/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:371131/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3260011/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3245914/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3234418/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3229159/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:3198880/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:127833/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1695383/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:168710/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1637126/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1602520/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1573573/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1538906/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1429622/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1414162/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1371398/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1326746/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:129046/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1715670/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1269383/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1231657/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1201547/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1122983/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1121542/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1118853/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:107290/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1053112/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1040320/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1014239/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1010527/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2166634/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2496893/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2413650/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2407778/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2398478/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2392898/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2305927/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2305365/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2297464/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2262567/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2254944/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2222161/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2190042/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1007531/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2120514/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2023152/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:2009581/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1967968/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1949734/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1943231/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1918277/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1902066/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:180575/37‑1 (MQ=255) gAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:1741669/37‑1 (MQ=255)  aaTCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTc  <  1:431807/36‑1 (MQ=255)                                     | GAATCGTTAGTGAAGCAGCTGCCAAACGGCTTTGGTC  >  minE/1636389‑1636425

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑