Missing coverage evidence...
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CACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCCGACGA  >  minE/1655493‑1655554                                                              | cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAAGGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2729356/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:803524/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:108326/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:796125/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:588288/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:434664/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:406173/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:383420/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:3029619/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2939340/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2902658/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2642995/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2637888/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2587525/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:2376855/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:1975528/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:1928065/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:1519325/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:1377339/62‑1 (MQ=255) cACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:1242526/62‑1 (MQ=255)  aCGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCcgacga  <  1:47199/61‑1 (MQ=255)                                                              | CACGAAAACGCCGCGTGGCTGGATGGTCAACGTCTGCCGCCGCAGGGCTACGCTGCCGACGA  >  minE/1655493‑1655554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑