Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1655886	1656020	135	56 [0]	[1] 106	ppk	polyphosphate kinase, component of RNA degradosome

AGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTC  >  minE/1655832‑1655885                                                      | aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:355334/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2379594/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2487548/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2638630/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:271721/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:27894/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2810087/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2826610/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2844720/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2914321/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2914357/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2985542/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:3028928/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:3049432/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1245719/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:460215/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:509448/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:52693/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:530081/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:560731/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:851953/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:875346/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:900112/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:907458/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:923931/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:986829/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:992870/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1932431/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1152345/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1254310/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1289709/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1345236/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1352314/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1382014/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1513966/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1522967/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1556395/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1583454/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1718358/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1746717/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1807304/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2312096/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:1967564/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2062491/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2164906/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2229936/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2233564/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2243539/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2284072/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2299231/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTT‑ATGAGTTCAATAAAGTc  <  1:2371873/53‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTCGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2125993/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATACCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2094323/54‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTTCCTGGGGAGCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2089637/54‑1 (MQ=255)  ggATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:2157043/53‑1 (MQ=255)  ggATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTc  <  1:656692/53‑1 (MQ=255)                                                      | AGGATGCGTTTCCTGGGGATCTATTCCAATAACCTTGATGAGTTCTATAAAGTC  >  minE/1655832‑1655885

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑