Missing coverage evidence...
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CCGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTGG  >  minE/1659064‑1659125                                                              | ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAATCAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:866027/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:408166/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2791768/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2858308/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2868360/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2964980/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2993466/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2996292/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:3067444/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:3085122/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:309711/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:312724/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:3288279/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:392506/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:269105/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:504447/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:516701/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:593681/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:622026/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:624786/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:667418/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:672535/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:808077/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:814579/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:972491/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1899062/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1045248/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1154825/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:117979/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1214438/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1243367/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1337288/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1645739/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1671367/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:180046/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1842510/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:185094/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1862019/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:101664/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:1905844/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2024932/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2110794/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2155825/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2162447/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:233046/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2360417/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2641334/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2650277/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2673778/1‑62 (MQ=255) ccGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTgg  >  1:2683508/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCGCGCTTTACCTTGTTTAAGAAGAAACAGTTCCTGCCACTGATACAGCTATTGCGCCTTGG  >  minE/1659064‑1659125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑