Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	140213	140249	37	52 [0]	[0] 4	ecpD	predicted periplasmic pilin chaperone

CTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGC  >  minE/140177‑140212                                    | cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCATCCTGGc  >  1:1932134/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:322549/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2715411/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2784443/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2829421/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2862736/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2903993/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2996934/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3032748/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3087772/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3129918/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3167583/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3179533/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3203596/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2698419/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3241582/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3252698/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:3294916/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:373403/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:492928/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:630666/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:684328/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:878459/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:888362/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:889622/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:894951/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:983089/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1610171/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1077971/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1210085/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1224290/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1229168/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1296156/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1304290/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1317680/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1391355/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1455056/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1480018/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1523091/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1559086/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:107710/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1691121/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:1910584/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:208250/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2120828/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2189622/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2427694/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2478223/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2566057/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2602169/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2668259/1‑36 (MQ=255) cTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGc  >  1:2672152/1‑36 (MQ=255)                                    | CTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGC  >  minE/140177‑140212

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑