Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1698718	1698748	31	80 [0]	[0] 31	csiE	stationary phase inducible protein

CGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGGCG  >  minE/1698656‑1698717                                                              | cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2390269/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2682162/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2677147/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2596094/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:255599/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2545417/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2486573/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2459773/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:24384/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2428416/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2686905/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2387973/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2383047/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2331791/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2294658/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2283874/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1033125/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2208191/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2193417/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:43330/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:96430/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:941827/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:931082/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:868339/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:861098/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:790966/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:755855/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:642150/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:563261/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2213819/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:428439/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:352064/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:3071161/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:305215/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:3033021/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:29872/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2984316/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2765658/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1706270/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:103809/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1136106/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1182741/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1231701/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1232766/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1265867/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1266665/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1369465/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1586642/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1589118/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1590967/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1660013/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2191838/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1723663/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1782224/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1834045/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2181259/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2147880/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2140228/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2057456/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1931914/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1903505/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1857271/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1846153/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1838349/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1797220/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTGAATTTCAAGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1156475/62‑1 (MQ=255) cGGAATCCTGCCTTAAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1994961/62‑1 (MQ=255)  ggAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:3282661/61‑1 (MQ=255)  ggAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1325053/61‑1 (MQ=255)  ggAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2270337/61‑1 (MQ=255)          gCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:268407/53‑1 (MQ=255)          gCCTTGAATTTCAGGTACCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1113709/53‑1 (MQ=255)           ccTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2168054/52‑1 (MQ=255)                 aTTTCAGGTAGCGCAGGAAATAGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2770122/46‑1 (MQ=255)                        gTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1265794/39‑1 (MQ=255)                          aGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1736819/37‑1 (MQ=255)                          aGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:492707/37‑1 (MQ=255)                          aGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1836747/37‑1 (MQ=255)                           gcgcAGTAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:1256248/36‑1 (MQ=255)                           gcgcAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGgcg  <  1:2170678/36‑1 (MQ=255)                                                              | CGGAATCCTGCCTTGAATTTCAGGTAGCGCAGGAAATTGGACGCCACTGGCAGCGTCGGGCG  >  minE/1698656‑1698717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑