Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701211	1701249	39	16 [0]	[0] 20	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

ATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACT  >  minE/1701149‑1701210                                                              | ataaaGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:3048903/4‑62 (MQ=255) aTTGAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:2159614/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCCCGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:811136/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:1556587/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:1622415/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:2018141/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:2154617/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:2328267/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:3054967/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:308680/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:369588/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:551778/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:741483/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:929544/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:943149/1‑62 (MQ=255) aTTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACt  >  1:97759/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACT  >  minE/1701149‑1701210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑