Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1723709	1723738	30	63 [0]	[0] 91	yfhK	predicted sensory kinase in two‑component system

CAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACA  >  minE/1723647‑1723708                                                              | cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCTCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2199826/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCTGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2368538/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCTAGCACCAACa  <  1:2373930/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCATCa  <  1:807960/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:3224206/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2482626/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2540864/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2541824/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2625294/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2655367/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2720350/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2765811/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2817166/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2876769/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2890131/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:301900/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:318401/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2354041/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:3242191/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:438992/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:477180/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:532943/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:535045/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:582602/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:644395/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:706002/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:81856/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:842536/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:893808/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:931627/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:981431/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2264645/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1077910/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1087935/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:113220/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1174525/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1308719/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1317440/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1439153/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1467851/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1479083/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1490130/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1557070/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1652861/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1657441/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1687338/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1743259/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1882781/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1948132/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1962326/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2004531/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2048513/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2101338/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2116269/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2224746/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2242906/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2246520/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1013734/62‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTGTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1069093/62‑1 (MQ=255) cAGCCCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2895289/62‑1 (MQ=255)  aGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1015124/61‑1 (MQ=255)  aGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:2570633/61‑1 (MQ=255)  aGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACa  <  1:1436476/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAGCGCCGCCTGATCGCTAAGCGCATTCAGGCTTTGCCAGGCTTGCCATGCCAGCACCAACA  >  minE/1723647‑1723708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑