Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1801254	1801301	48	38 [0]	[0] 15	[proX]	[proX]

CAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAT  >  minE/1801192‑1801253                                                              | cataaGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:686648/59‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACGAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2226283/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2688600/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1071838/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:226087/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2275977/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2330422/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:238786/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2483264/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2503474/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2585838/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2204301/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:28926/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2927521/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:474817/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:490687/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:800274/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:801801/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:933692/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1642626/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1178464/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1251425/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1383261/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:142724/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1471207/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1529154/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1570157/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2164541/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1646640/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1663410/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:168030/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1802470/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1898213/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:1944015/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2081740/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:2088003/62‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGATATTCAGCGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:372126/62‑1 (MQ=255)  aGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAt  <  1:135659/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAGAAGGCGATATTCAGGGACACGTTGATGGTTGGATCAAAGCCCACCAGCAGCAGTTCGAT  >  minE/1801192‑1801253

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑