Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1805438	1805518	81	34 [0]	[0] 22	emrA	multidrug efflux system

AGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCGATGAT  >  minE/1805376‑1805437                                                              | aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCCGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:85875/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGTgatgat  >  1:1906210/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:212525/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2088977/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2265696/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2274629/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2325865/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:237729/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2727913/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2727994/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2826987/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:362300/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:553452/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:594137/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:611923/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:630361/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:808703/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:847665/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1125660/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2085166/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:2034795/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1893258/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:181377/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1642908/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1610706/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1584713/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1580893/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1553044/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1522062/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1410178/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1385437/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1276152/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1250902/1‑62 (MQ=255) aGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCgatgat  >  1:1178047/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGATTGCCAATATGCGTATCGGTCAGCCGGTCACTATCACCACGGATATTTACGGCGATGAT  >  minE/1805376‑1805437

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑