Missing coverage evidence...
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GTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTG  >  minE/1806816‑1806877                                                              | gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACTTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:809238/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACTTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:805483/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCATGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:46165/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:3201699/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1031081/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2574964/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2587888/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2588227/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2593239/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2601342/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2617652/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2657957/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2691114/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:3096562/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:3132011/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2562344/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:3234699/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:404868/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:441466/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:589134/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:726740/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:89822/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:969335/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2405973/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1401382/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1407093/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1426268/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1467170/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1596763/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1695672/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1819246/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1868709/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1872603/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:191962/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1921339/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1945286/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2089246/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2287192/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2308231/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2311462/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:2489766/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTGGCGAGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1739549/62‑1 (MQ=255) gTCTGCTTCTACTCGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1798865/62‑1 (MQ=255)  tCTGCTTCTTCTGGCGAGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1618215/61‑1 (MQ=255)  tCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:219299/61‑1 (MQ=255)  tCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:1168756/61‑1 (MQ=255)  tCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCACGTCGGCCTg  <  1:865768/61‑1 (MQ=255)   cTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:789273/60‑1 (MQ=255)                    ccTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg  <  1:3083554/43‑1 (MQ=255)                                                              | GTCTGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTG  >  minE/1806816‑1806877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑