Missing coverage evidence...
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TTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGC  >  minE/1808312‑1808373                                                              | tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2790975/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:979824/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:928180/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:900766/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:709553/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:664943/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:653473/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:38025/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:3251980/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:3214473/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:3160287/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:3044789/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2942841/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2940190/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2882776/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1122938/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2708054/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:257343/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2535393/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2438010/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:221656/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2211746/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:2074837/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1962265/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1644178/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1616409/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1586492/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1453425/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1370825/62‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1122939/62‑1 (MQ=255)        tACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:601020/55‑1 (MQ=255)                       ttAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATcgc  <  1:1605633/40‑1 (MQ=255)                                                              | TTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGC  >  minE/1808312‑1808373

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑