Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1812421 1812449 29 143 [0] [0] 126 csrA/alaS pleiotropic regulatory protein for carbon source metabolism/alanyl‑tRNA synthetase

Only 100 of 143 total aligned reads displayed.

GCATTATCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTC  >  minE/1812359‑1812420
                                                             |
ctaTTATCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1728501/60‑1 (MQ=255)
     aTCCATCTTATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2206638/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAATAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2955364/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACTCATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3178955/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2930879/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3224754/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3213784/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3194532/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3183455/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3084936/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3072588/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3048752/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3047281/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2980782/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3280634/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2881926/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2881154/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2874740/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2857236/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2834227/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2786600/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2763946/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2741252/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2702410/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2652336/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2608542/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:517772/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:925264/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:864019/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:831135/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:828483/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:751114/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:731284/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:688995/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:678435/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:660707/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:596910/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:539503/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2590869/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:510153/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:480794/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:456961/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:411565/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:400867/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:385970/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:361100/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:356651/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:343725/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:3294823/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:329219/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1377808/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1794602/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1762333/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1723076/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1688548/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1585085/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1573876/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1502423/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1470625/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1411813/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1410982/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1409446/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1378266/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1833424/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:129646/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1295095/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1266062/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1225796/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1212833/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1158532/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1144170/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1123320/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1105129/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1054659/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1054014/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2064746/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2588007/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2562835/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:25256/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2433425/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2379999/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2260095/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2190604/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2163632/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2155778/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2107428/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2104852/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1002003/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2052667/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:2038984/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1975724/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1957274/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1919430/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:190784/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1900513/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1899379/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1860858/57‑1 (MQ=255)
     aTCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCAAAGCAGTc  <  1:262317/57‑1 (MQ=255)
                   gCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:1871081/43‑1 (MQ=255)
                           gTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTc  <  1:314533/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCATTATCCATCATATAACGCCAAAAAGTAAGCAATGACAAACACATTACATCTAAGCAGTC  >  minE/1812359‑1812420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑