Missing coverage evidence...
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AACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACA  >  minE/1823804‑1823864                                                             | aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:369473/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2465463/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2468250/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2545980/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2585453/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2735221/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:284551/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2872007/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2882213/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2883442/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:3152083/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:3184685/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1010254/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:441884/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:522804/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:686078/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:705684/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:751360/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:813466/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:896580/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:901727/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:917867/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:942280/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:993231/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2312871/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1003261/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1116575/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1125201/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1155401/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1204695/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:12431/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1413343/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1424657/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1467575/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:146926/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1572136/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1684601/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1821832/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1824650/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1834549/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:1854763/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:207627/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2119809/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2195832/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2232108/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:2232458/61‑1 (MQ=255) aaCTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:236004/61‑1 (MQ=255)         gTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca  <  1:996639/53‑1 (MQ=255)                                                             | AACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACA  >  minE/1823804‑1823864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑