Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1829093	1829109	17	23 [0]	[0] 66	mutS	methyl‑directed mismatch repair protein

TGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTGG  >  minE/1829033‑1829092                                                            | tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2132773/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:973542/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:699165/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:678907/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:382273/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:3053570/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2963687/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2651145/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2452590/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2391246/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2159657/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1045394/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2000627/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1737747/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1700510/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1677707/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1631447/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1490617/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1484391/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1328075/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1206648/60‑1 (MQ=255) tGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:1063955/60‑1 (MQ=255)  gCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTgg  <  1:2915740/59‑1 (MQ=255)                                                            | TGCACAGCGTGCAGGATGGCGCGGCGAGCAAAAGCTACGGCCTGGCGGTTGCAGCTCTGG  >  minE/1829033‑1829092

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑