Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1842055	1842065	11	37 [0]	[0] 43	ispD	4‑diphosphocytidyl‑2C‑methyl‑D‑erythritol synthase

GACACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGA  >  minE/1841994‑1842054                                                             | gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:544486/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1147682/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2925844/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:3010769/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:3056248/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:3085214/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:312798/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:3162377/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:462001/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:282698/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:587386/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:596166/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:711044/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:745413/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:75397/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:775901/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:818903/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:888009/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1158678/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1212335/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1614688/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1664625/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:1699264/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2054207/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2078868/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2198741/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2260776/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2404473/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2717872/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2733927/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2742702/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2807109/61‑1 (MQ=255) gacACGTTTCACCCGGGGATGCGCCACCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2430953/61‑1 (MQ=255)  acacGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2822904/60‑1 (MQ=255)  acacGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:791515/60‑1 (MQ=255)     cGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:2239423/57‑1 (MQ=255)                gggATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGa  <  1:284141/46‑1 (MQ=255)                                                             | GACACGTTTCACCCGGGGATGCGCCAGCAGCGCATGCACCGAGTGTTCAAGAATGGTTTGA  >  minE/1841994‑1842054

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑