Missing coverage evidence...
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TGCCGGAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACCA  >  minE/153198‑153259                                                              | cgCCGGAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:726110/61‑1 (MQ=255)     ggAACGCGCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:586847/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGTGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1517578/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCATAACCGGCTTTCACca  <  1:3239826/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:3002134/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:2155875/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:3030418/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:3099818/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:35911/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:42389/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:489512/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:554063/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:611473/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:651031/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:67101/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:845120/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:877935/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:2661844/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1002284/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:2057143/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:2004043/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:194774/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1897299/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1815219/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1805572/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1676160/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1648686/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1623918/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1484719/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1436013/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1339042/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:1258995/58‑1 (MQ=255)     ggAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCATAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACca  <  1:2056614/58‑1 (MQ=255)                                                              | TGCCGGAACGCCCGGCGAGTTTGGCTGGCCTAACGTGAGTGCGCCAGAACCGGCTTTCACCA  >  minE/153198‑153259

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑