Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1856917	1856917	1	29 [0]	[0] 62	ygcB/cysH	conserved hypothetical protein, member of DEAD box family/3'‑phosphoadenosine 5'‑phosphosulfate reductase

CTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAC  >  minE/1856855‑1856916                                                              | cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2492017/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:869788/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:835819/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:823549/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:680204/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:675246/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:666108/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:661063/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:599903/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:578686/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:39044/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:3250485/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2884197/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2642275/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2480469/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2118778/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2042115/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1987524/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1984819/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1784501/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1722137/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1650710/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1609963/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1566263/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1443680/62‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1346801/62‑1 (MQ=255)  tCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:1024593/61‑1 (MQ=255)  tCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:2432867/61‑1 (MQ=255)  tCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAc  <  1:3170912/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTCAGGTTGATAGAAATATCGCCTGGGGCTTTTGTCCATCTGGAACCTCGCGAATGCTTAAC  >  minE/1856855‑1856916

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑