Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1880651	1880702	52	54 [0]	[0] 12	chpR	antitoxin of the ChpA‑ChpR toxin‑antitoxin system

CAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAG  >  minE/1880604‑1880650                                               | cAGTCGATATTCTCGTTGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2485427/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:3071186/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1039157/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2394394/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2517823/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2615322/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:268970/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2696821/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2794965/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2830157/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2850293/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2920720/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:30235/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2335520/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:3074680/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:31919/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:3249760/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:328784/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:358618/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:46477/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:561337/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:598497/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:71064/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:88506/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:893513/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:979572/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1672604/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1042374/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:107639/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1077633/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1082581/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1083309/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1143343/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1176703/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1204642/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1284579/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1386494/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1519076/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2277278/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1677412/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1749332/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1929593/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1935644/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1962997/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1996308/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2046460/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2129343/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2196218/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2207569/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2233826/47‑1 (MQ=255) cAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGAGATGTCGTTGACCAg  <  1:1840960/47‑1 (MQ=255)  aGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:1562191/46‑1 (MQ=255)   gTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:2616356/45‑1 (MQ=255)      gATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAg  <  1:476779/42‑1 (MQ=255)                                               | CAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAG  >  minE/1880604‑1880650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑