Missing coverage evidence...
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ACAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGC  >  minE/1892798‑1892858                                                             | aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2898988/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2583186/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2712953/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2729557/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:274590/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2819888/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2834137/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2846325/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2882353/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2225023/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:3042101/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:396027/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:400781/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:468193/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:57210/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:92430/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:927855/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1100283/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2169061/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2089416/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:2068409/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1981105/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1925848/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:19251/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1618712/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1353912/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1288317/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1267250/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1260023/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1252624/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1176591/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1139390/1‑61 (MQ=255) aCAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGc  >  1:1108565/1‑61 (MQ=255)                                                             | ACAGTTGCAACGCTTTTTCACCATACAGACGCGCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGC  >  minE/1892798‑1892858

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑