Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1916684	1916684	1	24 [0]	[0] 11	nudH/mutH	nucleotide hydrolase/methyl‑directed mismatch repair protein

CAACGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTAA  >  minE/1916622‑1916683                                                              | caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2421041/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:962913/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:849815/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:761313/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:610404/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:333925/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:3210282/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:3195472/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:3167497/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2712640/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2654777/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1110939/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2355790/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:235444/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2217964/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:2127671/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:189057/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1859534/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1427785/62‑1 (MQ=255) caacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1333077/62‑1 (MQ=255)  aacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1860110/61‑1 (MQ=255)  aacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1698693/61‑1 (MQ=255)  aacGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:1454624/61‑1 (MQ=255)   acGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTaa  <  1:3132718/60‑1 (MQ=255)                                                              | CAACGCATGTGGAAAAAGTTACACTGCGAATATTCGGCACATAATTGCTGTTTGTTTTTTAA  >  minE/1916622‑1916683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑