Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1939835	1939860	26	41 [0]	[0] 38	ygfX	hypothetical protein

GCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCT  >  minE/1939773‑1939834                                                              | gCCTTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1729217/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACTCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:171302/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2457467/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2226684/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2492104/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2532519/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2594313/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2754865/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:277714/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2802469/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2803022/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2908174/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:299625/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:3256429/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:331037/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:479480/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:578588/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:580772/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:730659/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:89269/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:904132/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2024092/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1146773/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1199957/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1330148/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1356525/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1468337/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1499799/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:16043/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1664028/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1770336/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1802794/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1839249/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1874576/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1882167/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1990278/62‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1031133/62‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2956068/61‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:2775819/61‑1 (MQ=255)   cGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1825639/60‑1 (MQ=255)          cGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCt  <  1:1964125/53‑1 (MQ=255)                                                              | GCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCT  >  minE/1939773‑1939834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑