Missing coverage evidence...
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TTTGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAC  >  minE/2046576‑2046637 |                                                              tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGTCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1412247/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:3104063/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2351901/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2363692/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2400009/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2514028/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2560278/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2583115/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2644393/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2748424/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2909564/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2997282/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:300745/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:3051493/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2332188/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:3128021/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:3237983/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:3281512/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:371635/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:416119/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:500241/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:56952/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:706232/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:751147/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:84303/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:929757/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1679202/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1098122/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1156110/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1170434/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1181833/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1203587/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1404523/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1541259/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1612158/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1617414/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1641207/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:100619/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1751847/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1789214/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:182366/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1841485/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1933648/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2026050/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2053907/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2101025/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2113686/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2247912/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:2307440/62‑1 (MQ=255) tttGCCGACCAACACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAc  <  1:1438858/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTGCCGACCACCACGCCAGCCGCCGCATTGGCAAAGAAGCAGGCTTCTTCCAGCGAATTAC  >  minE/2046576‑2046637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑