Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2065070	2065130	61	2 [0]	[0] 56	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

GAGACCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACC  >  minE/2065131‑2065192 |                                                              gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTTTTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1871768/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCa                    >  1:3035344/1‑44 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGTCCGTGAAcc  >  1:3215506/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTg      >  1:1668353/1‑58 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:326515/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2560877/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2575950/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2694416/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2737003/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2790717/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2869455/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2962463/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2965701/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2966857/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:306974/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:3123525/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2515784/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:3297267/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:350710/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:403850/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:457775/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:48551/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:507207/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:509677/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:552699/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:567559/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:746824/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:832019/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:194856/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1103296/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1136607/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1192531/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1243427/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1260563/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1281630/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1362453/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1363823/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1416588/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1620775/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1737855/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1018881/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:1985734/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2022438/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2028280/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2063122/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2068354/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2081057/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2085169/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:212886/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2232498/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2269845/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:239356/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2417184/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAcc  >  1:2465626/1‑62 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAAc   >  1:393627/1‑61 (MQ=255) gagaCCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGACGTGAAcc  >  1:481727/1‑62 (MQ=255) |                                                              GAGACCATCAACAAGCTCAACCGTATTTCTCGCCAGATGCTGCAAGAGATGGGCCGTGAACC  >  minE/2065131‑2065192

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑