Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2077020 2077106 87 38 [0] [0] 81 [uxaA] [uxaA]

AAACTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCTTT  >  minE/2077107‑2077157
|                                                  
aaaCTCAACTATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3118550/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTTCGGCATCGCttt  <  1:144887/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3041923/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3259276/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3230601/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3210414/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3117051/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3107120/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3105656/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:308751/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3061634/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3060963/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:339101/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2919949/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2858210/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2846257/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2819314/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2753426/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2728612/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2670027/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2648810/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:756517/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:979716/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:949566/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:944224/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:911148/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:909971/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:839559/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:837014/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:817134/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:765035/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:3278059/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:676770/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:655450/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:610029/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:582755/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:550228/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:484644/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:402865/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:396526/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2631922/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1558637/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1054193/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1880938/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1865288/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1854299/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1824782/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1724044/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1710072/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1634059/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:160624/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1901814/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1517276/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:146879/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1461470/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1399491/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1300019/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1262143/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1167878/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1132862/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1130285/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:240558/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:258867/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2583813/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:258282/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2553132/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2552389/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2519801/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2510419/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2444871/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2414883/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1921171/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2378077/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2374336/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2368834/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2329379/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2213816/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2171940/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:2145852/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCttt  <  1:1962247/51‑1 (MQ=255)
aaaCTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTCCGGCATCGCttt  <  1:748422/51‑1 (MQ=255)
|                                                  
AAACTCAACGATGGTGTCGATAAATTCTTCCAGCAACTGCGGCATCGCTTT  >  minE/2077107‑2077157

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: