Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2085860	2085879	20	16 [0]	[0] 34	yqjF	predicted quinol oxidase subunit

AGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTGGTGGTGGT  >  minE/2085880‑2085940 |                                                             aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTTTGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:359702/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1235410/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:866638/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:864220/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:790582/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:764166/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:723537/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:556225/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:554726/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:328427/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:325736/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:3223028/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:3077848/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2933457/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2900440/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2887510/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2525536/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1193905/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1295587/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1343537/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1427839/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1430900/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1464103/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1480977/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1779493/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:1957765/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:198046/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2132423/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2286960/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2326150/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2518699/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtggtggt  <  1:2732242/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTggtgggggt  <  1:980634/61‑1 (MQ=255) aGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTCTggtggtggt  <  1:2950194/61‑1 (MQ=255) |                                                             AGCAATGGGCGTCCCGGGTTTTATGCTGCCACTGGTGATTCTGCTTGAGTTTGGTGGTGGT  >  minE/2085880‑2085940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑