Missing coverage evidence...
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GTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAATC  >  minE/2092041‑2092103 |                                                               gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTc                          >  1:30219/1‑39 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGaaaa    >  1:2452188/1‑61 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGaaaa    >  1:2686834/1‑61 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:415328/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:2489686/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:293608/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:295743/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:3144481/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:3288288/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:370254/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:2356721/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:422856/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:508469/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:545590/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:566196/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:791176/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:803636/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:835531/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:893851/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:997614/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1628672/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1025768/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1033427/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1044137/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1110683/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1249387/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1260335/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1273231/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1282882/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1404444/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1452895/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1001351/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1740782/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1743384/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1806807/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1825040/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:184232/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:1881589/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:2032505/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAAt   >  1:2122740/1‑62 (MQ=255) gTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCT‑CAGGCCAGCAAAATGGCGAAAATc  >  1:313711/1‑62 (MQ=255) |                                                               GTGAAGCTCAACACCGGTGCGTTCAGTACGATGGCGCTCCAGGCCAGCAAAATGGCGAAAATC  >  minE/2092041‑2092103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑