Missing coverage evidence...
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AACGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTC  >  minE/2119954‑2120015 |                                                              aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2855314/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:890511/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:865345/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:859992/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:776533/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:611433/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:605754/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:502846/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:3145349/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:3046107/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2968577/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:295894/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2893531/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:288712/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2864473/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:139503/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2729640/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2667696/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:261986/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2466387/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2400447/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2154126/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2124336/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:2055145/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1869649/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1818358/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1617085/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1588937/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1574252/62‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:1429674/62‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTc  <  1:3156753/62‑1 (MQ=255) |                                                              AACGGCGGTTCTGGTATTGCTTTAACGGGTAGCCCGATTACTCTCAGAGCGACAACCGACTC  >  minE/2119954‑2120015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑