Missing coverage evidence...
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GATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGG  >  minE/2165879‑2165940 |                                                              gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:3048398/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2551925/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2631255/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2653124/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2670854/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2696954/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2745007/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2745701/62‑1 (MQ=255) gATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTCGGCATTGCGCTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCgg  <  1:2789939/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑