Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2170630	2170632	3	97 [0]	[0] 32	rpoN	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

ATGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCCG  >  minE/2170633‑2170694 |                                                              aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGCCAGCATTCcg  >  1:1953455/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTcc   >  1:985445/1‑61 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTcc   >  1:3097054/1‑61 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2727114/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2573789/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2810134/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:285467/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:3084901/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:3101044/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:3123357/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:3177259/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:3213027/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:452976/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:518104/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:603963/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:650734/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:889553/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1008765/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2553404/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2537695/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2439315/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2238310/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2234521/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2141327/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2136178/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:2074477/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1746767/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:172885/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1666858/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1484135/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1070298/1‑62 (MQ=255) aTGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCcg  >  1:1054005/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATGTGCTGGTGCGTAAGCATAACGGTCACTGGACGGTAGAACTCAACAGTGACAGCATTCCG  >  minE/2170633‑2170694

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑