Missing coverage evidence...
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CGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCT  >  minE/2202576‑2202637 |                                                              cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAgct                            >  1:746010/1‑36 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACg                 >  1:1641965/1‑47 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTc   >  1:699158/1‑61 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2726761/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:973863/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:9552/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:938598/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:507028/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:479040/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:395618/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:3205339/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:3135084/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2917320/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2881211/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2812149/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2809261/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1124933/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2648496/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2633398/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2477553/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2371013/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:222154/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:2087219/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1849496/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1803516/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1474098/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1422059/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1404415/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCt  >  1:1373287/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTCCt  >  1:765282/1‑62 (MQ=255) cGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCCGTTTCt  >  1:1179523/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGTCCAGGCGATAACTCTCCGCAGGCGTTTGAGCTGCTTGTGGACGTCCTGCGCGGTTTCT  >  minE/2202576‑2202637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑