Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2204876 2204905 30 23 [1] [0] 116 aaeR predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

GACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACGCAGCA  >  minE/2204906‑2204967
|                                                             
gACGGTATCAAATCTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:969812/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgcagca  >  1:708841/1‑62 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgcagc   >  1:1215881/1‑61 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2696796/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2938760/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2919627/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2871182/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2827999/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2794652/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2780156/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2773267/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2742866/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2742017/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2728965/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2714129/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2701970/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3100583/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:268549/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2655096/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2595270/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2515737/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2454400/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2447535/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2349541/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:233920/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1011957/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:429646/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:974566/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:954574/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:922713/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:879481/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:863278/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:626277/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:623490/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:583646/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:556242/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:543744/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:436003/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2948017/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:394156/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:39054/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:382585/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3256958/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3203827/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3190364/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3153515/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3115806/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2307041/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3039924/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1264739/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2304676/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1611074/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1588654/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1516829/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1477719/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1459332/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1395323/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1310993/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1300913/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1268082/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1266731/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1714565/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1233954/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1222290/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1219698/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1136147/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1122638/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1103048/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1091846/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1074784/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1048228/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1047385/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:102849/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1972156/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2287769/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:22193/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2141656/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2132288/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2088194/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2079786/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2065439/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2008409/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1992351/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1734323/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1949279/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1890678/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1876865/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1851092/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1828671/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1824353/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1813293/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1810940/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:178979/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:1761122/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACAGTAGCACACgc      >  1:2018474/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACAGTAGCACACgc      >  1:2314055/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGATAAACCGTCGCACACgc      >  1:1141815/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGATAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:2193413/1‑58 (MQ=255)
gACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTCCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:338774/1‑58 (MQ=255)
gACGGCATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgc      >  1:3164741/1‑58 (MQ=255)
|                                                             
GACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACGCAGCA  >  minE/2204906‑2204967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: