Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2217829	2217829	1	34 [0]	[0] 54	yhdA	conserved inner membrane protein

CGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAA  >  minE/2217830‑2217891 |                                                              cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTAGCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1716891/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:409167/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2439414/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:254014/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:254371/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:258629/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2660105/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2806838/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2815189/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2853536/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2889592/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2944210/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2974932/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:3006430/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:3268490/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2409022/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:487699/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:514843/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:522343/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:535858/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:729041/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:761952/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:852669/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:872726/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:88360/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:911982/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:957948/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2375314/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:120013/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1224883/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1232855/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1283662/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1328231/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1347871/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1397506/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1464310/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1641447/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1770601/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1861543/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1897813/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1929840/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:204614/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2046772/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2099410/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2113609/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2128749/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2147440/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2149595/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2250902/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2251771/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2306037/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:2372959/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:1194346/62‑1 (MQ=255) cGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCATCCAGTAACGTTGCTaa  <  1:3248417/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGAATCATCATCACGATCCCGTGGGTACCTACTTTCTCCTGATCTTCCAGTAACGTTGCTAA  >  minE/2217830‑2217891

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑