Missing coverage evidence...
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TCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAC  >  minE/2254664‑2254725 |                                                              tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:310829/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2343230/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2368129/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2378298/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2383737/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2553588/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:272744/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2846799/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:3062532/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2276581/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:3183292/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:3219861/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:3243968/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:501969/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:542230/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:673985/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:686022/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1693661/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1051312/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:111649/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1151708/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1290706/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1516315/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1573591/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1580140/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1621454/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1018710/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1880086/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:1937133/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:202390/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2103943/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2156345/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2214260/62‑1 (MQ=255) tCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAc  <  1:2276068/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCGCAGTTTTCAGTGCGGTATCCGCCAGACCTTTACGAGCACCGTGGGTGGAGATGAAGTAC  >  minE/2254664‑2254725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑