Missing coverage evidence...
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GGCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTG  >  minE/2305955‑2306015 |                                                             ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:359582/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2383464/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1022072/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2432546/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2634422/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2739621/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2823368/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2909846/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2923964/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:3135684/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2384521/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:462006/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:468219/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:472842/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:48399/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:516256/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:575847/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:750291/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:838625/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:947920/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1779313/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1028362/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1054954/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1241112/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1299910/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1390887/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1464479/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1547776/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1586291/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1697813/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2338584/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1809774/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1830807/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1950257/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:202980/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2059285/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2194357/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2257079/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCAGCGCTg  <  1:2695150/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTATGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:2424709/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTAAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTg  <  1:1980567/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGATGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCTGCTCCGCGCTg  <  1:715652/61‑1 (MQ=255) |                                                             GGCGTGGCTGAAAGCGAAAAATGGTGAGGCGGCGATTGTGATCGGCACCCGCTCCGCGCTG  >  minE/2305955‑2306015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑