Missing coverage evidence...
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GGGTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAC  >  minE/2335200‑2335254 |                                                       gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:354864/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2524941/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2639141/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2681552/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2768393/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:3006993/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:3056112/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:336065/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:342174/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:343478/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2467831/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:387941/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:492118/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:636986/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:761992/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:850070/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:86103/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:8688/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:915635/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:951974/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1748175/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1217068/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1264210/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1272509/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1279218/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1293340/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1384179/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1403972/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1524547/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1655904/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1032237/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1795540/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1929972/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:1977467/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:199356/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2026958/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2116906/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2238267/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2340544/55‑1 (MQ=255) gggTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAc  <  1:2435729/55‑1 (MQ=255) |                                                       GGGTAAAGCCGATAAGTTCCCGTATGTCGGAACCACCTATCGTCTGACCGAGCAC  >  minE/2335200‑2335254

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑