Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343711	2343721	11	31 [0]	[0] 37	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

AATGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACGT  >  minE/2343722‑2343783 |                                                              aaTTTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1887727/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGc                         >  1:3185698/1‑39 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGc                         >  1:1640854/1‑39 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGc                         >  1:2790020/1‑39 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCgccagcc             >  1:1254814/1‑51 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCgccagc              >  1:2347607/1‑50 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCgcca                >  1:234925/1‑48 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2921835/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:251416/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2525314/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2535961/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2659310/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2773350/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2916139/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:911820/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:3030744/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:3081784/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:3134229/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:3224225/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:479474/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1019619/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2401063/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2311846/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:21283/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2093489/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:2037962/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1731622/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1693094/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1674377/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1481519/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1374572/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1344801/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1188175/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1102504/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACgt  >  1:1044592/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCCGCGAAGCGCCAGCCAAGCAGGACgt  >  1:2387925/1‑62 (MQ=255) aaTGTTCAGCATAACGGCCCAACGACCGATATCATAGGc                         >  1:1848592/1‑39 (MQ=38) |                                                              AATGTTCAGCTTAACGGCCCAACGACCGATATCATCGGCGAAGCGCCAGCCATGCAGGACGT  >  minE/2343722‑2343783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑