Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2344185	2344204	20	19 [0]	[0] 34	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

GGTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCT  >  minE/2344205‑2344266 |                                                              ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:520812/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2729384/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2841206/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2948983/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2956337/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2987603/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:431976/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:434226/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:458645/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2636829/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:569593/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:620154/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:701246/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:743405/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:771439/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:803598/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:921724/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2588751/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1051915/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:108780/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1390217/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1419839/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1457426/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1478639/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1562684/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1577181/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1874909/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1967010/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2184985/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2237866/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2509591/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1002770/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCAACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:2240764/62‑1 (MQ=255) ggTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTACACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCt  <  1:1804300/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGTAAGTTCCGTGAGGATCTGTTCCACCGCCTGAACGTTATCCGCGTTCATCTGCCGCCGCT  >  minE/2344205‑2344266

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑