Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2352387	2352389	3	10 [0]	[0] 37	yihG	predicted endonuclease

TCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCG  >  minE/2352390‑2352451 |                                                              tCAAGCGACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2703781/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTg                          >  1:368936/1‑38 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGTCGTGCTGGTCGCTGGATATGcgg  >  1:1479579/1‑60 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCg                       >  1:2830704/1‑41 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCt                   >  1:564072/1‑45 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGatat      >  1:1839074/1‑58 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGcc   >  1:549842/1‑61 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:3259183/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2585552/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2610642/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2638622/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2927557/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2946978/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:3203729/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2455951/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:468515/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:51462/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:550182/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:626611/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:748137/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:182776/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1183046/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1217293/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1275031/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1318740/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1440880/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1555280/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:163008/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1645982/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2539628/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1956050/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2137639/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2160679/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2282913/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:2359294/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1107376/1‑62 (MQ=255) tCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTCCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCg  >  1:1848956/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCAAGCAACAGCTGGCCTGGGTGCCATTTCTTGGCCTGGCGTGCTGGTCGCTGGATATGCCG  >  minE/2352390‑2352451

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑