Missing coverage evidence...
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ACGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGCC  >  minE/2393647‑2393686 |                                        aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:432226/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2220927/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2271577/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2285042/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2296187/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2629059/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2867917/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2896017/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:3016701/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:3149441/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2193122/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:434208/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:469432/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:690004/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:74655/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:747426/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:75273/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:89172/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:907265/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1443625/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1123669/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1142355/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1160127/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:125367/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1259972/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1272768/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:134318/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1349946/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1108451/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1496192/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1694938/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1699932/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1708683/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:1747602/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:177995/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2029615/40‑1 (MQ=255) aCGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGcc  <  1:2061851/40‑1 (MQ=255) |                                        ACGCACCGCTGGCGCGTCATGCACCTCTTTCACCGTTGCC  >  minE/2393647‑2393686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑