Missing coverage evidence...
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CATCGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTACAGCA  >  minE/2405613‑2405674 |                                                              catcGATTGCTCGGCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:934366/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2712280/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2704518/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2929101/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:3268670/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:3276526/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:385829/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:435148/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:479890/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:543938/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:59902/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:692627/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:708406/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:740314/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:748499/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:800813/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:847506/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:855418/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2024349/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1310044/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:147789/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1547570/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:164241/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1786323/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1819307/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1890098/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1905208/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:1233819/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2040744/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2088096/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2213064/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2256393/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2406861/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2411285/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:2450517/62‑1 (MQ=255) catcGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTAcagca  <  1:252003/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATCGATTGCTCGCCGTTGAAGTGCAGCGTACGCACTTCGTTCCACGAGTTGCGGTACAGCA  >  minE/2405613‑2405674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑