Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2421358	2421387	30	18 [0]	[0] 70	wzxE	O‑antigen translocase

ATCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCG  >  minE/2421388‑2421449 |                                                              aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTc      >  1:3047844/1‑58 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGc   >  1:1400733/1‑61 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGc   >  1:1735697/1‑61 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2932387/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:372620/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:340406/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:3264038/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:3173431/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:3162249/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:3111310/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2983902/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:427510/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2809893/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2734327/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:272470/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2609704/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2606474/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2568435/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2552724/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:567186/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:934332/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:80431/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:743774/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:704994/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:65399/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:645601/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:593935/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:586146/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:41786/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:559955/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:543447/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:511828/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:485017/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:483574/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:477050/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2479194/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1619362/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1891221/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1878938/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:184208/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1783456/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1764616/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1698115/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1667804/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1648482/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1912056/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1589387/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1506889/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1439656/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1310642/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1254529/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1223691/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1215421/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2337423/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1010677/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2469257/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2468198/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2458716/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2432710/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2398459/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2384496/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2349128/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2490898/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2223944/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2156174/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2077034/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2056000/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1970508/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:1914143/1‑62 (MQ=255) aTCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTAGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCg  >  1:2304971/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCACGCAGCAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCCACTGCCGGTAAGACGAATTTCAGCG  >  minE/2421388‑2421449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑