Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2500574	2500613	40	21 [0]	[0] 43	uhpB	sensory histidine kinase in two‑component regulatory sytem with UhpA

CGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAC  >  minE/2500614‑2500675 |                                                              cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTTGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1726292/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCggg                    >  1:394608/1‑44 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGa                 >  1:1530673/1‑47 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGCCATCTGGTCTGGTAc  >  1:1317995/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACAtctggtc        >  1:3212486/1‑56 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACAtctg           >  1:1819984/1‑53 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACAtctg           >  1:1068969/1‑53 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACAtctg           >  1:321686/1‑53 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTa   >  1:1886536/1‑61 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTa   >  1:2041651/1‑61 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2628867/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2424765/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2970683/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2992542/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2379955/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2346063/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:3193918/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:3190718/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2152427/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:417696/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:524847/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:703149/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:749369/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:912752/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:981676/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2207037/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1112992/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1131699/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1231666/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1271809/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1273462/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1340616/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1438902/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1447612/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1635254/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:1645563/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:194467/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2026951/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:202985/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:216727/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAc  >  1:2253257/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGAAc  >  1:305868/1‑62 (MQ=255) cGCTCGGTCAGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTa   >  1:1448277/1‑61 (MQ=255) |                                                              CGCTCGGTCCGTCACTGGTTTCTCAGCCAATCAACTGGCGCGGGCGACATCTGGTCTGGTAC  >  minE/2500614‑2500675

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑