Missing coverage evidence...
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CGCGTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGA  >  minE/2513613‑2513673 |                                                             cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2305246/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:854295/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:719014/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:519645/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:333736/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:3211863/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:3024996/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:3023605/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2847371/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:282480/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2688649/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2658337/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1250501/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2276359/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:214182/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2141218/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:2102462/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1939697/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1909969/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1868961/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1645223/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1591339/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:145476/61‑1 (MQ=255) cgcgTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGa  <  1:1279511/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGCGTCTTTGAGCGTGCGGTATCCGTGCTGGGTAACGTAAGCTTGTCGTTGTTCCTGGCGA  >  minE/2513613‑2513673

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑