Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2535627	2535637	11	68 [0]	[0] 60	rfaP	kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide

ACGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGGACG  >  minE/2535638‑2535689 |                                                    aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:358433/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1189729/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2700469/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2826019/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2851411/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2971053/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2982981/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2988973/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3177932/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3183932/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3227247/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3242029/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3267227/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:3292939/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:354435/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2661810/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:584441/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:602174/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:635868/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:730349/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:739576/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:754183/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:770156/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:791083/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:795049/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:849891/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:854852/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:880075/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:902402/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:950570/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1798895/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1290223/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1296060/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1430843/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1504719/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1580407/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1598922/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1606360/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1633066/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1647864/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1719405/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1737255/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1748227/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1791320/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2584832/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1902329/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:1955764/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2130550/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2141559/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2240012/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2249990/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2269686/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2330705/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2384527/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2401298/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2484373/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:249678/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2526231/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:2534315/52‑1 (MQ=255) aCGCTTTAAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGgacg  <  1:785958/52‑1 (MQ=255) |                                                    ACGCTTTGAACTGTCCGGGAAAAGCTATTTTCTTAAATGGCACAAGGGGACG  >  minE/2535638‑2535689

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑