Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2546874	2546880	7	47 [0]	[0] 35	rfaD	ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding

CCTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCTC  >  minE/2546881‑2546943 |                                                               ccTTCAAACTGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:3058111/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGATATGGAAAGCGACGCt   >  1:847974/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGc    >  1:787124/1‑61 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2898492/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2407016/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2485771/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2539040/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2620914/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2670341/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2679949/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2722246/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2851487/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2362211/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:3214484/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:42906/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:891722/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:956906/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:995499/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2210339/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1373110/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1433941/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1509965/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1561988/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1566751/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1613163/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1636827/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1700166/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1840696/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1866814/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2038020/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2074695/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:213697/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:2183028/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCt   >  1:1299961/1‑62 (MQ=255) ccTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTT‑AGATGGAAAGCGACGCTc  >  1:1349962/1‑62 (MQ=255) |                                                               CCTTCAAACAGCTTCGGTGATTCACCGTTGTTAAGCTGGGTGTTGAGATGGAAAGCGACGCTC  >  minE/2546881‑2546943

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑