Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2561714	2561839	126	30 [0]	[0] 8	lldR	DNA‑binding transcriptional repressor

TTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGC  >  minE/2561840‑2561900 |                                                             ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:1145336/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:1199139/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:1708851/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:2647897/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:2757374/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:2879033/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:658887/1‑61 (MQ=255) ttGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGc  >  1:666095/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGC  >  minE/2561840‑2561900

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑