Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	228113	228114	2	76 [0]	[1] 48	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

AGTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGT  >  minE/228114‑228176  |                                                              aGTCATATGT‑AATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2930523/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3192923/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2802244/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2845517/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2858703/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2917500/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2918567/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2934495/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3057454/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3110137/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3118742/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3146376/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:266013/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:3217922/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:34997/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:353245/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:377027/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:463770/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:647181/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:657634/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:677507/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:677864/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:723774/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:910695/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2008369/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1113636/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1379811/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1391152/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1421794/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:142736/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1457344/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1519789/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1674477/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1738570/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1879596/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1946587/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:1016681/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2063779/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2125731/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2152400/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:226976/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:229915/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2322101/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2357611/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2426816/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2508661/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2515175/62‑1 (MQ=255)  gTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGt  <  1:2618793/62‑1 (MQ=255)  |                                                              AGTCATATGTCAATGACGTGCCGAAGCCATCGCCGTTTTGCTTTTTAACGTCGCGGTTTTCGT  >  minE/228114‑228176

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑