Missing coverage evidence...
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AACTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTGC  >  minE/2582933‑2582994 |                                                              aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3275509/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2608693/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2735682/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2806065/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2827420/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2878801/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2880788/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3022610/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3093450/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3094987/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3098942/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:3163201/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2585225/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:367797/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:436155/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:464403/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:49617/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:503329/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:51526/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:575089/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:744700/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:817130/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:983652/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:987425/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2546412/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1072451/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1076300/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1137167/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1231325/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1231554/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1347199/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1421381/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:142804/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1444236/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1455649/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1475332/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1664146/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1774236/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1825302/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1855021/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2159439/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2168526/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2376494/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2485144/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:2543823/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1040151/62‑1 (MQ=255) aaCTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCATACCAAATCTGGCAGTTTTTgc  <  1:1044488/62‑1 (MQ=255) |                                                              AACTGTTATGCAAAACTACTTTGTGGATAAATTTTGGTCCTACCAAATCTGGCAGTTTTTGC  >  minE/2582933‑2582994

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑